Na votação, realizada na Comissão Parlamentar de Assuntos Constitucionais, Direitos, Liberdades e Garantias, o requerimento teve os votos favoráveis do PS, PCP e BE.
A 19 de janeiro, já depois de ter sido afastado do cargo, Rui Pereira escreveu uma carta dirigida ao presidente daquela comissão parlamentar, Fernando Negrão, a disponibilizar-se para ser ouvido. Na carta, Rui Pereira assegurava que as justificações do despacho da sua exoneração pelo secretário da Estado da Justiça não correspondiam à verdade, referindo que não estavam esclarecidas as circunstâncias em que decorreu colapso da plataforma Citius, nem apuradas as responsabilidades técnicas. “Nem devidamente esclarecido o quadro em que aquela plataforma se encontra em funcionamento”, adiantava na carta.
A 13 de janeiro, o secretário de Estado da Justiça, António Costa Moura, considerou que o presidente e o vogal do Instituto de Gestão Financeira e Equipamentos da Justiça (IGFEJ), que gere a plataforma informática Citius, não tinham “capacidade adequada para conduzir, com eficácia, o processo de adaptação” do sistema à nova organização judiciária.
Em comunicado enviado à agência Lusa, António Costa Moura vincou que Rui Pereira, que ocupava as funções de presidente do IGFEJ, e Carlos Brito, vogal, não tiveram “capacidade adequada” para “garantir o cumprimento das orientações e objetivos superiormente fixados” e por isso foram exonerados dos cargos.
O governante defendeu ainda que se constatou “a existência de flagrantes contradições entre o mencionado” no relatório remetido à tutela pelo instituto e “o conteúdo do despacho final do processo de inquérito” conduzido pelo Ministério Público.
Depois de ser exonerado, Rui Pereira considerou que o despacho do secretário de Estado tinha intenções persecutórias e defendeu que a sua responsabilidade no ‘crash’ da plataforma tinha sido efabulada pela tutela. Numa resposta enviada na altura à agência Lusa, Rui Pereira sublinhou que o despacho da sua exoneração, era “único em toda a Administração Pública portuguesa” e “uma peça com intentos claramente persecutórios”.
Depois disso, numa audição na Comissão Parlamentar de Assuntos Constitucionais, a ministra da Justiça negou que tivesse “varrido para debaixo do tapete” eventuais responsabilidades políticas relacionadas com o bloqueio do Citius e a demissão dos dirigentes do Instituto (IGFEJ) que gere aquela plataforma informática. “Nunca varri para debaixo do tapete e sempre disse o que tinha para dizer, afirmando as minhas convicções”, disse Paula Teixeira da Cruz, respondendo a acusações feitas pela deputada Isabel Moreira (PS) durante a audição.
O colapso do Citius verificou-se no arranque no novo mapa judiciário que entrou em vigor a 01 de setembro, causando diversos constrangimentos aos tribunais e ao trabalho dos profissionais forenses, e só ficou operacional em finais de outubro. Contudo, o sistema só foi declarado completamente normalizado a 31 de dezembro.
